ols4
活跃·★ 90·Apache-2.0·更新于 2026-05-29
★ 时下流行★ RAG / 知识库★ 可观测性
本体查找服务（OLS）是一个生物医学本体库，旨在提供对最新本体版本的一站式访问。
OLS4是本体查找服务，一个生物医学本体库，通过网站、REST API和MCP服务器提供对最新本体版本的一站式访问。它利用Docker进行部署，后端组件基于Spring Boot，前端采用React，并使用Solr和Neo4j等专用数据库进行搜索和图查询。
#本体管理#生物信息学#REST API#知识图谱#Docker#Kubernetes#Solr#Neo4j
01
功能特性
01集成式生物医学本体库
02多入口访问：网站、REST API和MCP服务器
03通过Solr和Neo4j实现高级搜索和图查询
04支持Docker和Kubernetes的容器化部署
05模块化架构，包含独立的数据加载器、后端API和前端
02
兼容性
Docker
运行时
已通过文档验证
Kubernetes
编排
已通过文档验证
Helm
包管理器
已通过文档验证
Java
后端语言
已通过文档验证
React
前端框架
已通过文档验证
Solr
数据库
已通过文档验证
03
快速开始
1
$ OLS4_CONFIG=./dataload/configs/efo.json ./dataload.sh
2
$ HOST_UID=$(id -u) HOST_GID=$(id -g) docker compose up
04
使用场景
↳获取最新版本的生物医学本体
↳将生物医学本体集成到研究和应用中
↳为特定本体部署自定义本体查找服务
05
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评论
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- SSage Garcia2026年5月18日
EMBL-EBI ontology lookup via MCP is exactly what bioinformatics pipelines need
- SSterling Clark2026年5月1日
The EBI infrastructure backing this means uptime is excellent
- SSutton Rivera2026年4月30日
Used this for automated gene ontology annotation workflows, works consistently
- Sam Rivera2026年4月28日
Handles complex ontology hierarchies and cross-references reliably