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ChatSpatial

活跃·★ 45·MIT·更新于 2026-10-20

ChatSpatial 是一个 MCP 服务器，通过自然语言命令简化了复杂的空间转录组学分析任务。它将数十行Python代码替换为简单的英文提示，使高级生物信息学分析变得易于访问。

#空间转录组学#自然语言处理#生物信息学#AI代理#基因组学#模型上下文协议#Python#单细胞分析
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MCP 服务器代码助手工作流自动化RAG / 知识库多智能体浏览器自动化大模型基础设施开发者工具可观测性

与 Anthropic, OpenAI 或 Microsoft 无关。

指南
$ 安装
$ python3 -m venv venv && source venv/bin/activate && uv pip install chatspatial
↗ 访问官网★ GitHub
01

功能特性

01用于空间转录组学分析的自然语言接口。
02支持15个类别超过60种空间分析方法（例如，空间域、去卷积、细胞通讯）。
03兼容多种空间组学技术，包括10x Visium, Xenium, Slide-seq v2, MERFISH, seqFISH。
04可与任何模型上下文协议（MCP）兼容的客户端（例如，Claude, OpenCode, Codex）配合使用。
05显著降低代码复杂性，将多行脚本转换为单行提示。
02

兼容性

Python
运行时
已通过文档验证
Python 3.11+
版本
已通过文档验证
Model Context Protocol (MCP)
协议
已通过文档验证
03

快速开始

1
$ python3 -m venv venv
2
$ source venv/bin/activate
3
$ uv pip install chatspatial
04

使用场景

↳加载空间数据并可视化组织结构。
↳使用SpaGCN等多种算法识别空间域。
↳寻找空间可变基因并生成热图。
↳通过自然语言执行高级分析，如细胞类型去卷积、细胞通讯和轨迹分析。
05

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cafferychen777 /
ChatSpatial
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ChatSpatial 是一个基于自然语言的 MCP 服务器，用于进行空间转录组学分析。

45MIT
最后更新3天前
状态活跃
分类语音处理
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